Ensino Médio é o que antigamente chamava-se "Colegial". Compreende do 1º ao 3º ano e, geralmente, engloba jovens de 15 a 17 anos. Muitas matérias específicas passam a ser ensinadas nesta fase. A vida destes jovens muda muito e os estudos passam a tomar ainda mais tempo deles com a aproximação da formatura e a necessidade de se escolher uma profissão com o vestibular.
O Ensino Médio é a fase onde ex-crianças se tornaram futuros adultos. É um período conturbado onde os jovens devem escolher como passarão seus próximos anos. Por isso o San Conrado prioriza uma orientação imparcial e conclusiva, para que seu filho se torne um ótimo profissional e um ser humano realizado na vida pessoal e profissional